Мир Регалзин, место обитания Великого Духа Маны, состоит из трех континентов, окруженных огромным морем. В мире Regallzine регион Эсвиор находился под властью короля Слайта. Однако власть короля Слайта над Южным Эсвиором стала ослабевать. Сегодня Южный Эсвиор больше не находится под властью короля.
Игрокам предстоит взять на себя роль молодого алхимика по имени Клейн Кислинг, внука знаменитого алхимика. Клейн, мечтающий превзойти своего наставника, путешествует по миру Regallzine, чтобы раскрыть скрытые секреты алхимии.